Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms