Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms