Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 SETD1B-204ENST00000619791 5901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 UMODL1-205ENST00000408910 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 PCDHGA5-201ENST00000518069 4602 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC9.17□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 TP73-203ENST00000357733 4899 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 STOX2-201ENST00000308497 10458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 CHL1-201ENST00000256509 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 WNK1-202ENST00000340908 11208 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 DSP-202ENST00000418664 7812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 AL590644.1-201ENST00000412427 4676 ntTSL 4 BASIC9.17□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 ADCY7-201ENST00000254235 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC9.16□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 PML-210ENST00000563500 4502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 DYSF-202ENST00000394120 6543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 MAOA-204ENST00000542639 5438 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 NLRC3-202ENST00000359128 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms