Protein–RNA interactions for Protein: Q6ICC9

RTL6, Retrotransposon Gag-like protein 6, humanhuman

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL6Q6ICC9 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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RTL6Q6ICC9 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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RTL6Q6ICC9 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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RTL6Q6ICC9 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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