Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms