Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms