Protein–RNA interactions for Protein: O75385

ULK1, Serine/threonine-protein kinase ULK1, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK1O75385 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ULK1O75385 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ULK1O75385 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ULK1O75385 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ULK1O75385 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ULK1O75385 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ULK1O75385 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ULK1O75385 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ULK1O75385 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ULK1O75385 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ULK1O75385 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ULK1O75385 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ULK1O75385 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ULK1O75385 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ULK1O75385 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ULK1O75385 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ULK1O75385 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ULK1O75385 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ULK1O75385 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ULK1O75385 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ULK1O75385 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ULK1O75385 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ULK1O75385 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ULK1O75385 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ULK1O75385 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ULK1O75385 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ULK1O75385 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ULK1O75385 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ULK1O75385 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ULK1O75385 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ULK1O75385 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ULK1O75385 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ULK1O75385 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ULK1O75385 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ULK1O75385 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ULK1O75385 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ULK1O75385 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ULK1O75385 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ULK1O75385 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ULK1O75385 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ULK1O75385 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ULK1O75385 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ULK1O75385 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ULK1O75385 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ULK1O75385 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ULK1O75385 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ULK1O75385 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ULK1O75385 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ULK1O75385 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ULK1O75385 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ULK1O75385 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ULK1O75385 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ULK1O75385 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ULK1O75385 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ULK1O75385 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ULK1O75385 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ULK1O75385 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ULK1O75385 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ULK1O75385 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ULK1O75385 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ULK1O75385 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ULK1O75385 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ULK1O75385 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ULK1O75385 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ULK1O75385 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ULK1O75385 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ULK1O75385 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ULK1O75385 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ULK1O75385 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ULK1O75385 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ULK1O75385 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ULK1O75385 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ULK1O75385 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ULK1O75385 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ULK1O75385 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ULK1O75385 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ULK1O75385 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ULK1O75385 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ULK1O75385 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ULK1O75385 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ULK1O75385 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ULK1O75385 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ULK1O75385 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ULK1O75385 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ULK1O75385 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ULK1O75385 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ULK1O75385 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ULK1O75385 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ULK1O75385 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ULK1O75385 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ULK1O75385 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ULK1O75385 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ULK1O75385 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ULK1O75385 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ULK1O75385 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ULK1O75385 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ULK1O75385 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ULK1O75385 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ULK1O75385 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ULK1O75385 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms