Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 LINC00226-202ENST00000618204 1052 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms