Protein–RNA interactions for Protein: Q99674

CGREF1, Cell growth regulator with EF hand domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGREF1Q99674 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGREF1Q99674 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGREF1Q99674 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGREF1Q99674 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGREF1Q99674 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGREF1Q99674 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGREF1Q99674 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGREF1Q99674 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGREF1Q99674 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGREF1Q99674 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGREF1Q99674 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGREF1Q99674 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGREF1Q99674 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGREF1Q99674 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGREF1Q99674 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGREF1Q99674 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGREF1Q99674 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGREF1Q99674 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGREF1Q99674 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGREF1Q99674 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGREF1Q99674 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGREF1Q99674 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGREF1Q99674 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGREF1Q99674 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGREF1Q99674 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGREF1Q99674 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGREF1Q99674 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGREF1Q99674 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGREF1Q99674 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGREF1Q99674 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CGREF1Q99674 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CGREF1Q99674 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGREF1Q99674 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CGREF1Q99674 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CGREF1Q99674 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CGREF1Q99674 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGREF1Q99674 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGREF1Q99674 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGREF1Q99674 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CGREF1Q99674 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CGREF1Q99674 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGREF1Q99674 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGREF1Q99674 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGREF1Q99674 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGREF1Q99674 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGREF1Q99674 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGREF1Q99674 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGREF1Q99674 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CGREF1Q99674 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGREF1Q99674 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGREF1Q99674 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGREF1Q99674 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGREF1Q99674 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGREF1Q99674 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGREF1Q99674 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGREF1Q99674 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGREF1Q99674 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGREF1Q99674 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGREF1Q99674 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGREF1Q99674 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGREF1Q99674 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGREF1Q99674 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGREF1Q99674 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGREF1Q99674 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGREF1Q99674 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGREF1Q99674 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGREF1Q99674 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGREF1Q99674 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGREF1Q99674 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGREF1Q99674 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGREF1Q99674 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGREF1Q99674 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGREF1Q99674 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGREF1Q99674 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGREF1Q99674 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGREF1Q99674 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGREF1Q99674 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGREF1Q99674 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGREF1Q99674 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGREF1Q99674 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CGREF1Q99674 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGREF1Q99674 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGREF1Q99674 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CGREF1Q99674 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CGREF1Q99674 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CGREF1Q99674 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGREF1Q99674 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGREF1Q99674 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CGREF1Q99674 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGREF1Q99674 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGREF1Q99674 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGREF1Q99674 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGREF1Q99674 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGREF1Q99674 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGREF1Q99674 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CGREF1Q99674 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CGREF1Q99674 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CGREF1Q99674 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CGREF1Q99674 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CGREF1Q99674 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms