Protein–RNA interactions for Protein: Q96B97

SH3KBP1, SH3 domain-containing kinase-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3KBP1Q96B97 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3KBP1Q96B97 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SH3KBP1Q96B97 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SH3KBP1Q96B97 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SH3KBP1Q96B97 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SH3KBP1Q96B97 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SH3KBP1Q96B97 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SH3KBP1Q96B97 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SH3KBP1Q96B97 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SH3KBP1Q96B97 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SH3KBP1Q96B97 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SH3KBP1Q96B97 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SH3KBP1Q96B97 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3KBP1Q96B97 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3KBP1Q96B97 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3KBP1Q96B97 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3KBP1Q96B97 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3KBP1Q96B97 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3KBP1Q96B97 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3KBP1Q96B97 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3KBP1Q96B97 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3KBP1Q96B97 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3KBP1Q96B97 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3KBP1Q96B97 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3KBP1Q96B97 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms