Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL38Q2WGJ6 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms