Protein–RNA interactions for Protein: P29317

EPHA2, Ephrin type-A receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA2P29317 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EPHA2P29317 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EPHA2P29317 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EPHA2P29317 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EPHA2P29317 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EPHA2P29317 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EPHA2P29317 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EPHA2P29317 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EPHA2P29317 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EPHA2P29317 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EPHA2P29317 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EPHA2P29317 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EPHA2P29317 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EPHA2P29317 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EPHA2P29317 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EPHA2P29317 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EPHA2P29317 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
EPHA2P29317 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EPHA2P29317 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EPHA2P29317 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EPHA2P29317 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EPHA2P29317 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EPHA2P29317 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EPHA2P29317 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EPHA2P29317 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EPHA2P29317 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EPHA2P29317 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EPHA2P29317 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EPHA2P29317 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
EPHA2P29317 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EPHA2P29317 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EPHA2P29317 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EPHA2P29317 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EPHA2P29317 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EPHA2P29317 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EPHA2P29317 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EPHA2P29317 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EPHA2P29317 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
EPHA2P29317 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EPHA2P29317 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
EPHA2P29317 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPHA2P29317 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPHA2P29317 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPHA2P29317 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPHA2P29317 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPHA2P29317 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPHA2P29317 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPHA2P29317 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPHA2P29317 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPHA2P29317 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPHA2P29317 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPHA2P29317 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPHA2P29317 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPHA2P29317 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
EPHA2P29317 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
EPHA2P29317 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
EPHA2P29317 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPHA2P29317 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPHA2P29317 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPHA2P29317 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPHA2P29317 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPHA2P29317 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
EPHA2P29317 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPHA2P29317 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPHA2P29317 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPHA2P29317 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPHA2P29317 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPHA2P29317 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPHA2P29317 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPHA2P29317 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
EPHA2P29317 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPHA2P29317 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPHA2P29317 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPHA2P29317 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPHA2P29317 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPHA2P29317 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPHA2P29317 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPHA2P29317 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPHA2P29317 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPHA2P29317 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPHA2P29317 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPHA2P29317 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPHA2P29317 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EPHA2P29317 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
EPHA2P29317 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EPHA2P29317 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
EPHA2P29317 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
EPHA2P29317 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
EPHA2P29317 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
EPHA2P29317 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
EPHA2P29317 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
EPHA2P29317 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EPHA2P29317 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
EPHA2P29317 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EPHA2P29317 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EPHA2P29317 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EPHA2P29317 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
EPHA2P29317 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EPHA2P29317 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EPHA2P29317 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms