Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6F2

TMEM38A, Trimeric intracellular cation channel type A, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM38AQ9H6F2 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM38AQ9H6F2 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM38AQ9H6F2 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM38AQ9H6F2 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM38AQ9H6F2 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM38AQ9H6F2 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM38AQ9H6F2 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM38AQ9H6F2 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM38AQ9H6F2 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM38AQ9H6F2 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM38AQ9H6F2 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM38AQ9H6F2 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM38AQ9H6F2 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM38AQ9H6F2 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMEM38AQ9H6F2 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM38AQ9H6F2 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM38AQ9H6F2 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM38AQ9H6F2 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM38AQ9H6F2 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM38AQ9H6F2 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM38AQ9H6F2 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM38AQ9H6F2 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM38AQ9H6F2 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM38AQ9H6F2 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM38AQ9H6F2 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM38AQ9H6F2 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM38AQ9H6F2 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM38AQ9H6F2 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM38AQ9H6F2 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM38AQ9H6F2 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM38AQ9H6F2 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM38AQ9H6F2 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM38AQ9H6F2 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM38AQ9H6F2 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM38AQ9H6F2 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM38AQ9H6F2 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM38AQ9H6F2 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMEM38AQ9H6F2 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMEM38AQ9H6F2 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMEM38AQ9H6F2 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM38AQ9H6F2 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMEM38AQ9H6F2 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM38AQ9H6F2 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM38AQ9H6F2 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM38AQ9H6F2 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM38AQ9H6F2 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM38AQ9H6F2 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM38AQ9H6F2 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM38AQ9H6F2 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM38AQ9H6F2 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM38AQ9H6F2 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM38AQ9H6F2 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM38AQ9H6F2 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM38AQ9H6F2 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM38AQ9H6F2 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM38AQ9H6F2 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMEM38AQ9H6F2 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM38AQ9H6F2 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM38AQ9H6F2 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM38AQ9H6F2 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM38AQ9H6F2 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM38AQ9H6F2 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM38AQ9H6F2 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM38AQ9H6F2 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM38AQ9H6F2 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM38AQ9H6F2 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM38AQ9H6F2 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM38AQ9H6F2 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM38AQ9H6F2 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM38AQ9H6F2 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM38AQ9H6F2 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM38AQ9H6F2 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM38AQ9H6F2 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM38AQ9H6F2 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM38AQ9H6F2 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM38AQ9H6F2 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM38AQ9H6F2 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM38AQ9H6F2 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM38AQ9H6F2 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM38AQ9H6F2 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM38AQ9H6F2 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM38AQ9H6F2 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM38AQ9H6F2 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM38AQ9H6F2 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM38AQ9H6F2 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM38AQ9H6F2 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM38AQ9H6F2 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TMEM38AQ9H6F2 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM38AQ9H6F2 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM38AQ9H6F2 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM38AQ9H6F2 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM38AQ9H6F2 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM38AQ9H6F2 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM38AQ9H6F2 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM38AQ9H6F2 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM38AQ9H6F2 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TMEM38AQ9H6F2 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM38AQ9H6F2 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM38AQ9H6F2 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM38AQ9H6F2 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms