Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPR1

ETFRF1, Electron transfer flavoprotein regulatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 90 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFRF1Q6IPR1 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ETFRF1Q6IPR1 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms