Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SYPL1Q16563 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYPL1Q16563 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYPL1Q16563 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SYPL1Q16563 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYPL1Q16563 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYPL1Q16563 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYPL1Q16563 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SYPL1Q16563 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SYPL1Q16563 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SYPL1Q16563 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYPL1Q16563 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYPL1Q16563 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYPL1Q16563 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SYPL1Q16563 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYPL1Q16563 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYPL1Q16563 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYPL1Q16563 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYPL1Q16563 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYPL1Q16563 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYPL1Q16563 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYPL1Q16563 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SYPL1Q16563 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYPL1Q16563 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SYPL1Q16563 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SYPL1Q16563 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SYPL1Q16563 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SYPL1Q16563 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SYPL1Q16563 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SYPL1Q16563 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYPL1Q16563 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYPL1Q16563 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYPL1Q16563 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SYPL1Q16563 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYPL1Q16563 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYPL1Q16563 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYPL1Q16563 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYPL1Q16563 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SYPL1Q16563 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYPL1Q16563 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SYPL1Q16563 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYPL1Q16563 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SYPL1Q16563 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SYPL1Q16563 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYPL1Q16563 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SYPL1Q16563 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SYPL1Q16563 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SYPL1Q16563 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYPL1Q16563 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYPL1Q16563 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYPL1Q16563 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYPL1Q16563 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYPL1Q16563 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
SYPL1Q16563 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYPL1Q16563 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYPL1Q16563 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SYPL1Q16563 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SYPL1Q16563 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYPL1Q16563 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYPL1Q16563 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYPL1Q16563 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYPL1Q16563 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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SYPL1Q16563 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYPL1Q16563 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYPL1Q16563 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SYPL1Q16563 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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SYPL1Q16563 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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SYPL1Q16563 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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SYPL1Q16563 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
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SYPL1Q16563 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SYPL1Q16563 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYPL1Q16563 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYPL1Q16563 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYPL1Q16563 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SYPL1Q16563 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYPL1Q16563 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYPL1Q16563 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYPL1Q16563 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYPL1Q16563 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SYPL1Q16563 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SYPL1Q16563 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SYPL1Q16563 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYPL1Q16563 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SYPL1Q16563 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SYPL1Q16563 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYPL1Q16563 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SYPL1Q16563 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SYPL1Q16563 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SYPL1Q16563 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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