Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
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