Protein–RNA interactions for Protein: Q06033

ITIH3, Inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain H3, humanhuman

Predictions only

Length 890 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITIH3Q06033 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITIH3Q06033 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITIH3Q06033 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITIH3Q06033 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITIH3Q06033 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITIH3Q06033 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITIH3Q06033 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITIH3Q06033 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITIH3Q06033 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITIH3Q06033 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITIH3Q06033 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITIH3Q06033 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITIH3Q06033 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITIH3Q06033 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITIH3Q06033 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITIH3Q06033 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITIH3Q06033 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITIH3Q06033 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITIH3Q06033 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ITIH3Q06033 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITIH3Q06033 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITIH3Q06033 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITIH3Q06033 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITIH3Q06033 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITIH3Q06033 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITIH3Q06033 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITIH3Q06033 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITIH3Q06033 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITIH3Q06033 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITIH3Q06033 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITIH3Q06033 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ITIH3Q06033 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITIH3Q06033 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITIH3Q06033 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITIH3Q06033 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITIH3Q06033 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITIH3Q06033 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITIH3Q06033 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITIH3Q06033 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITIH3Q06033 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITIH3Q06033 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITIH3Q06033 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITIH3Q06033 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITIH3Q06033 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITIH3Q06033 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITIH3Q06033 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITIH3Q06033 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITIH3Q06033 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITIH3Q06033 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITIH3Q06033 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITIH3Q06033 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITIH3Q06033 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITIH3Q06033 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITIH3Q06033 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITIH3Q06033 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITIH3Q06033 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITIH3Q06033 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITIH3Q06033 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ITIH3Q06033 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITIH3Q06033 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ITIH3Q06033 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITIH3Q06033 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITIH3Q06033 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ITIH3Q06033 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITIH3Q06033 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ITIH3Q06033 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ITIH3Q06033 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITIH3Q06033 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITIH3Q06033 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITIH3Q06033 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITIH3Q06033 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITIH3Q06033 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITIH3Q06033 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITIH3Q06033 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITIH3Q06033 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITIH3Q06033 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITIH3Q06033 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITIH3Q06033 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITIH3Q06033 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITIH3Q06033 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITIH3Q06033 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITIH3Q06033 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITIH3Q06033 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITIH3Q06033 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITIH3Q06033 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITIH3Q06033 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITIH3Q06033 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITIH3Q06033 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITIH3Q06033 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ITIH3Q06033 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITIH3Q06033 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITIH3Q06033 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITIH3Q06033 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ITIH3Q06033 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITIH3Q06033 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITIH3Q06033 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITIH3Q06033 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITIH3Q06033 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITIH3Q06033 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITIH3Q06033 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms