Protein–RNA interactions for Protein: P50213

IDH3A, Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IDH3AP50213 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IDH3AP50213 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
IDH3AP50213 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IDH3AP50213 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IDH3AP50213 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
IDH3AP50213 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IDH3AP50213 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IDH3AP50213 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IDH3AP50213 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IDH3AP50213 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IDH3AP50213 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IDH3AP50213 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IDH3AP50213 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IDH3AP50213 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IDH3AP50213 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IDH3AP50213 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IDH3AP50213 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IDH3AP50213 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IDH3AP50213 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IDH3AP50213 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IDH3AP50213 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IDH3AP50213 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IDH3AP50213 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IDH3AP50213 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IDH3AP50213 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IDH3AP50213 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IDH3AP50213 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IDH3AP50213 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IDH3AP50213 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IDH3AP50213 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
IDH3AP50213 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
IDH3AP50213 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
IDH3AP50213 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IDH3AP50213 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IDH3AP50213 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IDH3AP50213 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IDH3AP50213 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IDH3AP50213 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IDH3AP50213 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IDH3AP50213 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IDH3AP50213 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IDH3AP50213 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IDH3AP50213 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IDH3AP50213 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IDH3AP50213 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IDH3AP50213 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IDH3AP50213 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IDH3AP50213 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IDH3AP50213 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IDH3AP50213 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IDH3AP50213 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IDH3AP50213 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IDH3AP50213 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IDH3AP50213 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IDH3AP50213 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IDH3AP50213 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IDH3AP50213 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IDH3AP50213 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IDH3AP50213 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IDH3AP50213 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IDH3AP50213 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IDH3AP50213 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IDH3AP50213 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IDH3AP50213 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IDH3AP50213 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IDH3AP50213 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IDH3AP50213 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IDH3AP50213 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IDH3AP50213 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
IDH3AP50213 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IDH3AP50213 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IDH3AP50213 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IDH3AP50213 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IDH3AP50213 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IDH3AP50213 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IDH3AP50213 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IDH3AP50213 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IDH3AP50213 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IDH3AP50213 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IDH3AP50213 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IDH3AP50213 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IDH3AP50213 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IDH3AP50213 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IDH3AP50213 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IDH3AP50213 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IDH3AP50213 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IDH3AP50213 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IDH3AP50213 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IDH3AP50213 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
IDH3AP50213 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IDH3AP50213 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IDH3AP50213 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IDH3AP50213 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IDH3AP50213 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IDH3AP50213 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IDH3AP50213 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IDH3AP50213 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IDH3AP50213 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IDH3AP50213 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IDH3AP50213 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms