Protein–RNA interactions for Protein: P16234

PDGFRA, Platelet-derived growth factor receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRAP16234 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PDGFRAP16234 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PDGFRAP16234 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDGFRAP16234 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDGFRAP16234 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDGFRAP16234 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDGFRAP16234 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDGFRAP16234 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDGFRAP16234 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDGFRAP16234 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PDGFRAP16234 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PDGFRAP16234 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDGFRAP16234 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PDGFRAP16234 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDGFRAP16234 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDGFRAP16234 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDGFRAP16234 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDGFRAP16234 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDGFRAP16234 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PDGFRAP16234 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDGFRAP16234 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDGFRAP16234 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDGFRAP16234 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDGFRAP16234 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDGFRAP16234 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDGFRAP16234 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDGFRAP16234 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDGFRAP16234 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDGFRAP16234 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDGFRAP16234 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDGFRAP16234 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDGFRAP16234 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDGFRAP16234 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDGFRAP16234 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDGFRAP16234 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PDGFRAP16234 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PDGFRAP16234 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDGFRAP16234 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDGFRAP16234 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDGFRAP16234 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDGFRAP16234 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDGFRAP16234 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDGFRAP16234 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDGFRAP16234 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PDGFRAP16234 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDGFRAP16234 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDGFRAP16234 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDGFRAP16234 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDGFRAP16234 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDGFRAP16234 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDGFRAP16234 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDGFRAP16234 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDGFRAP16234 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDGFRAP16234 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDGFRAP16234 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDGFRAP16234 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PDGFRAP16234 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDGFRAP16234 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDGFRAP16234 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDGFRAP16234 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDGFRAP16234 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDGFRAP16234 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDGFRAP16234 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDGFRAP16234 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDGFRAP16234 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDGFRAP16234 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDGFRAP16234 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDGFRAP16234 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDGFRAP16234 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDGFRAP16234 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDGFRAP16234 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PDGFRAP16234 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PDGFRAP16234 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDGFRAP16234 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDGFRAP16234 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDGFRAP16234 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDGFRAP16234 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDGFRAP16234 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PDGFRAP16234 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDGFRAP16234 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDGFRAP16234 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDGFRAP16234 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDGFRAP16234 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDGFRAP16234 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDGFRAP16234 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDGFRAP16234 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDGFRAP16234 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDGFRAP16234 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PDGFRAP16234 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDGFRAP16234 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDGFRAP16234 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDGFRAP16234 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDGFRAP16234 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDGFRAP16234 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDGFRAP16234 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDGFRAP16234 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDGFRAP16234 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDGFRAP16234 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDGFRAP16234 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDGFRAP16234 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms