Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL63

MKLN1, Muskelin, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKLN1Q9UL63 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms