Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB3IPQ96QF0 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms