Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIN3BO75182 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms