Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
MAP3K4Q9Y6R4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
MAP3K4Q9Y6R4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
MAP3K4Q9Y6R4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
MAP3K4Q9Y6R4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
MAP3K4Q9Y6R4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
MAP3K4Q9Y6R4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
MAP3K4Q9Y6R4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
MAP3K4Q9Y6R4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
MAP3K4Q9Y6R4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
MAP3K4Q9Y6R4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
MAP3K4Q9Y6R4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
MAP3K4Q9Y6R4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
MAP3K4Q9Y6R4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
MAP3K4Q9Y6R4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.49
MAP3K4Q9Y6R4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
MAP3K4Q9Y6R4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
MAP3K4Q9Y6R4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
MAP3K4Q9Y6R4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC36.81■■■■□ 3.48
MAP3K4Q9Y6R4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
MAP3K4Q9Y6R4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
MAP3K4Q9Y6R4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
MAP3K4Q9Y6R4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC36.81■■■■□ 3.48
MAP3K4Q9Y6R4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
MAP3K4Q9Y6R4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
MAP3K4Q9Y6R4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
MAP3K4Q9Y6R4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
MAP3K4Q9Y6R4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
MAP3K4Q9Y6R4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
MAP3K4Q9Y6R4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
MAP3K4Q9Y6R4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC36.78■■■■□ 3.48
MAP3K4Q9Y6R4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC36.78■■■■□ 3.48
MAP3K4Q9Y6R4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
MAP3K4Q9Y6R4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
MAP3K4Q9Y6R4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
MAP3K4Q9Y6R4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
MAP3K4Q9Y6R4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
MAP3K4Q9Y6R4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
MAP3K4Q9Y6R4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
MAP3K4Q9Y6R4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
MAP3K4Q9Y6R4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
MAP3K4Q9Y6R4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
MAP3K4Q9Y6R4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
MAP3K4Q9Y6R4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
MAP3K4Q9Y6R4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
MAP3K4Q9Y6R4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
MAP3K4Q9Y6R4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
MAP3K4Q9Y6R4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
MAP3K4Q9Y6R4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
MAP3K4Q9Y6R4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
MAP3K4Q9Y6R4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
MAP3K4Q9Y6R4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
MAP3K4Q9Y6R4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
MAP3K4Q9Y6R4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC36.73■■■■□ 3.47
MAP3K4Q9Y6R4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC36.73■■■■□ 3.47
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
MAP3K4Q9Y6R4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
MAP3K4Q9Y6R4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
MAP3K4Q9Y6R4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
MAP3K4Q9Y6R4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
MAP3K4Q9Y6R4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC36.71■■■■□ 3.47
MAP3K4Q9Y6R4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
MAP3K4Q9Y6R4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.47
MAP3K4Q9Y6R4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
MAP3K4Q9Y6R4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
MAP3K4Q9Y6R4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
MAP3K4Q9Y6R4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
MAP3K4Q9Y6R4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
MAP3K4Q9Y6R4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC36.67■■■■□ 3.46
MAP3K4Q9Y6R4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC36.67■■■■□ 3.46
MAP3K4Q9Y6R4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
MAP3K4Q9Y6R4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
MAP3K4Q9Y6R4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
MAP3K4Q9Y6R4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
MAP3K4Q9Y6R4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
MAP3K4Q9Y6R4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
MAP3K4Q9Y6R4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
MAP3K4Q9Y6R4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
MAP3K4Q9Y6R4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
MAP3K4Q9Y6R4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
MAP3K4Q9Y6R4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
MAP3K4Q9Y6R4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
MAP3K4Q9Y6R4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
MAP3K4Q9Y6R4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
MAP3K4Q9Y6R4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
MAP3K4Q9Y6R4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
MAP3K4Q9Y6R4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
MAP3K4Q9Y6R4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
MAP3K4Q9Y6R4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
MAP3K4Q9Y6R4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC36.61■■■■□ 3.45
MAP3K4Q9Y6R4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC36.61■■■■□ 3.45
MAP3K4Q9Y6R4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms