Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H8

GJA3, Gap junction alpha-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA3Q9Y6H8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GJA3Q9Y6H8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
GJA3Q9Y6H8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GJA3Q9Y6H8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GJA3Q9Y6H8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GJA3Q9Y6H8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GJA3Q9Y6H8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GJA3Q9Y6H8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GJA3Q9Y6H8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GJA3Q9Y6H8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GJA3Q9Y6H8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GJA3Q9Y6H8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GJA3Q9Y6H8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GJA3Q9Y6H8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GJA3Q9Y6H8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GJA3Q9Y6H8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GJA3Q9Y6H8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GJA3Q9Y6H8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GJA3Q9Y6H8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
GJA3Q9Y6H8 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GJA3Q9Y6H8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GJA3Q9Y6H8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GJA3Q9Y6H8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GJA3Q9Y6H8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GJA3Q9Y6H8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GJA3Q9Y6H8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GJA3Q9Y6H8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
GJA3Q9Y6H8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
GJA3Q9Y6H8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
GJA3Q9Y6H8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GJA3Q9Y6H8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GJA3Q9Y6H8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GJA3Q9Y6H8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GJA3Q9Y6H8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GJA3Q9Y6H8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GJA3Q9Y6H8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GJA3Q9Y6H8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GJA3Q9Y6H8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GJA3Q9Y6H8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GJA3Q9Y6H8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GJA3Q9Y6H8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GJA3Q9Y6H8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GJA3Q9Y6H8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GJA3Q9Y6H8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GJA3Q9Y6H8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GJA3Q9Y6H8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GJA3Q9Y6H8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GJA3Q9Y6H8 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GJA3Q9Y6H8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GJA3Q9Y6H8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GJA3Q9Y6H8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GJA3Q9Y6H8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GJA3Q9Y6H8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GJA3Q9Y6H8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GJA3Q9Y6H8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GJA3Q9Y6H8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GJA3Q9Y6H8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GJA3Q9Y6H8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GJA3Q9Y6H8 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GJA3Q9Y6H8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
GJA3Q9Y6H8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GJA3Q9Y6H8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GJA3Q9Y6H8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GJA3Q9Y6H8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GJA3Q9Y6H8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GJA3Q9Y6H8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GJA3Q9Y6H8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
GJA3Q9Y6H8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GJA3Q9Y6H8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GJA3Q9Y6H8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GJA3Q9Y6H8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GJA3Q9Y6H8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
GJA3Q9Y6H8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
GJA3Q9Y6H8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
GJA3Q9Y6H8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GJA3Q9Y6H8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
GJA3Q9Y6H8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GJA3Q9Y6H8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GJA3Q9Y6H8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
GJA3Q9Y6H8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GJA3Q9Y6H8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
GJA3Q9Y6H8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GJA3Q9Y6H8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GJA3Q9Y6H8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GJA3Q9Y6H8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GJA3Q9Y6H8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GJA3Q9Y6H8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GJA3Q9Y6H8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GJA3Q9Y6H8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
GJA3Q9Y6H8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GJA3Q9Y6H8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GJA3Q9Y6H8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GJA3Q9Y6H8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GJA3Q9Y6H8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GJA3Q9Y6H8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GJA3Q9Y6H8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GJA3Q9Y6H8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GJA3Q9Y6H8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GJA3Q9Y6H8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GJA3Q9Y6H8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms