Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5H5

PCDHA9, Protocadherin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA9Q9Y5H5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHA9Q9Y5H5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PCDHA9Q9Y5H5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PCDHA9Q9Y5H5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHA9Q9Y5H5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHA9Q9Y5H5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHA9Q9Y5H5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHA9Q9Y5H5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHA9Q9Y5H5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHA9Q9Y5H5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHA9Q9Y5H5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHA9Q9Y5H5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHA9Q9Y5H5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHA9Q9Y5H5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHA9Q9Y5H5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHA9Q9Y5H5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHA9Q9Y5H5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHA9Q9Y5H5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHA9Q9Y5H5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHA9Q9Y5H5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHA9Q9Y5H5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHA9Q9Y5H5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHA9Q9Y5H5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHA9Q9Y5H5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHA9Q9Y5H5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHA9Q9Y5H5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHA9Q9Y5H5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHA9Q9Y5H5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHA9Q9Y5H5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHA9Q9Y5H5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHA9Q9Y5H5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHA9Q9Y5H5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHA9Q9Y5H5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHA9Q9Y5H5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHA9Q9Y5H5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHA9Q9Y5H5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHA9Q9Y5H5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHA9Q9Y5H5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHA9Q9Y5H5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHA9Q9Y5H5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHA9Q9Y5H5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDHA9Q9Y5H5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDHA9Q9Y5H5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDHA9Q9Y5H5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PCDHA9Q9Y5H5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDHA9Q9Y5H5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDHA9Q9Y5H5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDHA9Q9Y5H5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDHA9Q9Y5H5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDHA9Q9Y5H5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDHA9Q9Y5H5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDHA9Q9Y5H5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHA9Q9Y5H5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHA9Q9Y5H5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHA9Q9Y5H5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHA9Q9Y5H5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHA9Q9Y5H5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHA9Q9Y5H5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHA9Q9Y5H5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHA9Q9Y5H5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHA9Q9Y5H5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHA9Q9Y5H5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHA9Q9Y5H5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHA9Q9Y5H5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHA9Q9Y5H5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHA9Q9Y5H5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHA9Q9Y5H5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHA9Q9Y5H5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHA9Q9Y5H5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHA9Q9Y5H5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHA9Q9Y5H5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHA9Q9Y5H5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHA9Q9Y5H5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHA9Q9Y5H5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHA9Q9Y5H5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHA9Q9Y5H5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHA9Q9Y5H5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHA9Q9Y5H5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHA9Q9Y5H5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHA9Q9Y5H5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHA9Q9Y5H5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHA9Q9Y5H5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHA9Q9Y5H5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHA9Q9Y5H5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHA9Q9Y5H5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDHA9Q9Y5H5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDHA9Q9Y5H5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDHA9Q9Y5H5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDHA9Q9Y5H5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDHA9Q9Y5H5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDHA9Q9Y5H5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCDHA9Q9Y5H5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCDHA9Q9Y5H5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCDHA9Q9Y5H5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCDHA9Q9Y5H5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCDHA9Q9Y5H5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCDHA9Q9Y5H5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PCDHA9Q9Y5H5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PCDHA9Q9Y5H5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDHA9Q9Y5H5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms