Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ3

PTPRQ, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, humanhuman

Predictions only

Length 2,332 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQQ9UMZ3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRQQ9UMZ3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRQQ9UMZ3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRQQ9UMZ3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRQQ9UMZ3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRQQ9UMZ3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRQQ9UMZ3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRQQ9UMZ3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRQQ9UMZ3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRQQ9UMZ3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRQQ9UMZ3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRQQ9UMZ3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRQQ9UMZ3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRQQ9UMZ3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRQQ9UMZ3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRQQ9UMZ3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRQQ9UMZ3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRQQ9UMZ3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRQQ9UMZ3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRQQ9UMZ3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRQQ9UMZ3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRQQ9UMZ3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRQQ9UMZ3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRQQ9UMZ3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRQQ9UMZ3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRQQ9UMZ3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRQQ9UMZ3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRQQ9UMZ3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRQQ9UMZ3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRQQ9UMZ3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRQQ9UMZ3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRQQ9UMZ3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRQQ9UMZ3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRQQ9UMZ3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRQQ9UMZ3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRQQ9UMZ3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRQQ9UMZ3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRQQ9UMZ3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRQQ9UMZ3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRQQ9UMZ3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRQQ9UMZ3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRQQ9UMZ3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRQQ9UMZ3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRQQ9UMZ3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRQQ9UMZ3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRQQ9UMZ3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRQQ9UMZ3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRQQ9UMZ3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PTPRQQ9UMZ3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRQQ9UMZ3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRQQ9UMZ3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRQQ9UMZ3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRQQ9UMZ3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRQQ9UMZ3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRQQ9UMZ3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRQQ9UMZ3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRQQ9UMZ3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRQQ9UMZ3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRQQ9UMZ3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRQQ9UMZ3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRQQ9UMZ3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRQQ9UMZ3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRQQ9UMZ3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRQQ9UMZ3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRQQ9UMZ3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRQQ9UMZ3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRQQ9UMZ3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRQQ9UMZ3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRQQ9UMZ3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRQQ9UMZ3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRQQ9UMZ3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRQQ9UMZ3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRQQ9UMZ3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRQQ9UMZ3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRQQ9UMZ3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRQQ9UMZ3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRQQ9UMZ3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRQQ9UMZ3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRQQ9UMZ3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRQQ9UMZ3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRQQ9UMZ3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRQQ9UMZ3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRQQ9UMZ3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRQQ9UMZ3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRQQ9UMZ3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRQQ9UMZ3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRQQ9UMZ3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRQQ9UMZ3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRQQ9UMZ3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRQQ9UMZ3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRQQ9UMZ3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRQQ9UMZ3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRQQ9UMZ3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRQQ9UMZ3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRQQ9UMZ3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRQQ9UMZ3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRQQ9UMZ3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRQQ9UMZ3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRQQ9UMZ3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRQQ9UMZ3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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