Protein–RNA interactions for Protein: Q9H875

PRKRIP1, PRKR-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1Q9H875 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PRKRIP1Q9H875 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PRKRIP1Q9H875 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PRKRIP1Q9H875 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PRKRIP1Q9H875 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PRKRIP1Q9H875 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PRKRIP1Q9H875 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PRKRIP1Q9H875 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PRKRIP1Q9H875 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
PRKRIP1Q9H875 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PRKRIP1Q9H875 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
PRKRIP1Q9H875 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
PRKRIP1Q9H875 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
PRKRIP1Q9H875 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
PRKRIP1Q9H875 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
PRKRIP1Q9H875 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
PRKRIP1Q9H875 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PRKRIP1Q9H875 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PRKRIP1Q9H875 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PRKRIP1Q9H875 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PRKRIP1Q9H875 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PRKRIP1Q9H875 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PRKRIP1Q9H875 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PRKRIP1Q9H875 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PRKRIP1Q9H875 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PRKRIP1Q9H875 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PRKRIP1Q9H875 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PRKRIP1Q9H875 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
PRKRIP1Q9H875 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PRKRIP1Q9H875 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PRKRIP1Q9H875 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PRKRIP1Q9H875 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PRKRIP1Q9H875 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PRKRIP1Q9H875 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
PRKRIP1Q9H875 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PRKRIP1Q9H875 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PRKRIP1Q9H875 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PRKRIP1Q9H875 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PRKRIP1Q9H875 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PRKRIP1Q9H875 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PRKRIP1Q9H875 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PRKRIP1Q9H875 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PRKRIP1Q9H875 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
PRKRIP1Q9H875 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PRKRIP1Q9H875 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PRKRIP1Q9H875 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PRKRIP1Q9H875 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.73
PRKRIP1Q9H875 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
PRKRIP1Q9H875 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
PRKRIP1Q9H875 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PRKRIP1Q9H875 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
PRKRIP1Q9H875 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PRKRIP1Q9H875 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PRKRIP1Q9H875 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
PRKRIP1Q9H875 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PRKRIP1Q9H875 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PRKRIP1Q9H875 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PRKRIP1Q9H875 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PRKRIP1Q9H875 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PRKRIP1Q9H875 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PRKRIP1Q9H875 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PRKRIP1Q9H875 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PRKRIP1Q9H875 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PRKRIP1Q9H875 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PRKRIP1Q9H875 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PRKRIP1Q9H875 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PRKRIP1Q9H875 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PRKRIP1Q9H875 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PRKRIP1Q9H875 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PRKRIP1Q9H875 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PRKRIP1Q9H875 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PRKRIP1Q9H875 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PRKRIP1Q9H875 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PRKRIP1Q9H875 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PRKRIP1Q9H875 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PRKRIP1Q9H875 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PRKRIP1Q9H875 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PRKRIP1Q9H875 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
PRKRIP1Q9H875 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
PRKRIP1Q9H875 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
PRKRIP1Q9H875 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
PRKRIP1Q9H875 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
PRKRIP1Q9H875 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
PRKRIP1Q9H875 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PRKRIP1Q9H875 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
PRKRIP1Q9H875 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PRKRIP1Q9H875 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PRKRIP1Q9H875 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
PRKRIP1Q9H875 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PRKRIP1Q9H875 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
PRKRIP1Q9H875 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
PRKRIP1Q9H875 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
PRKRIP1Q9H875 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
PRKRIP1Q9H875 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
PRKRIP1Q9H875 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PRKRIP1Q9H875 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PRKRIP1Q9H875 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PRKRIP1Q9H875 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PRKRIP1Q9H875 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PRKRIP1Q9H875 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms