Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3S1

SEMA4A, Semaphorin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4AQ9H3S1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SEMA4AQ9H3S1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SEMA4AQ9H3S1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SEMA4AQ9H3S1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SEMA4AQ9H3S1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SEMA4AQ9H3S1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SEMA4AQ9H3S1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SEMA4AQ9H3S1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEMA4AQ9H3S1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEMA4AQ9H3S1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEMA4AQ9H3S1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SEMA4AQ9H3S1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SEMA4AQ9H3S1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SEMA4AQ9H3S1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SEMA4AQ9H3S1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SEMA4AQ9H3S1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEMA4AQ9H3S1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEMA4AQ9H3S1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEMA4AQ9H3S1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEMA4AQ9H3S1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEMA4AQ9H3S1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SEMA4AQ9H3S1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEMA4AQ9H3S1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEMA4AQ9H3S1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEMA4AQ9H3S1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEMA4AQ9H3S1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SEMA4AQ9H3S1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEMA4AQ9H3S1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SEMA4AQ9H3S1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEMA4AQ9H3S1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEMA4AQ9H3S1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEMA4AQ9H3S1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEMA4AQ9H3S1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEMA4AQ9H3S1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEMA4AQ9H3S1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEMA4AQ9H3S1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEMA4AQ9H3S1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEMA4AQ9H3S1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEMA4AQ9H3S1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEMA4AQ9H3S1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEMA4AQ9H3S1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEMA4AQ9H3S1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEMA4AQ9H3S1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEMA4AQ9H3S1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SEMA4AQ9H3S1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEMA4AQ9H3S1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEMA4AQ9H3S1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEMA4AQ9H3S1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEMA4AQ9H3S1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEMA4AQ9H3S1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEMA4AQ9H3S1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEMA4AQ9H3S1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEMA4AQ9H3S1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEMA4AQ9H3S1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SEMA4AQ9H3S1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEMA4AQ9H3S1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEMA4AQ9H3S1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEMA4AQ9H3S1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEMA4AQ9H3S1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEMA4AQ9H3S1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEMA4AQ9H3S1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEMA4AQ9H3S1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEMA4AQ9H3S1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SEMA4AQ9H3S1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SEMA4AQ9H3S1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SEMA4AQ9H3S1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SEMA4AQ9H3S1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SEMA4AQ9H3S1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SEMA4AQ9H3S1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SEMA4AQ9H3S1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SEMA4AQ9H3S1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEMA4AQ9H3S1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEMA4AQ9H3S1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEMA4AQ9H3S1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEMA4AQ9H3S1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEMA4AQ9H3S1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEMA4AQ9H3S1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEMA4AQ9H3S1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEMA4AQ9H3S1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEMA4AQ9H3S1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEMA4AQ9H3S1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEMA4AQ9H3S1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEMA4AQ9H3S1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEMA4AQ9H3S1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEMA4AQ9H3S1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEMA4AQ9H3S1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEMA4AQ9H3S1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEMA4AQ9H3S1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEMA4AQ9H3S1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEMA4AQ9H3S1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEMA4AQ9H3S1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEMA4AQ9H3S1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEMA4AQ9H3S1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEMA4AQ9H3S1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SEMA4AQ9H3S1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEMA4AQ9H3S1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEMA4AQ9H3S1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEMA4AQ9H3S1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEMA4AQ9H3S1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEMA4AQ9H3S1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms