Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW4

TM6SF2, Transmembrane 6 superfamily member 2, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF2Q9BZW4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TM6SF2Q9BZW4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TM6SF2Q9BZW4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TM6SF2Q9BZW4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TM6SF2Q9BZW4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TM6SF2Q9BZW4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TM6SF2Q9BZW4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TM6SF2Q9BZW4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TM6SF2Q9BZW4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TM6SF2Q9BZW4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TM6SF2Q9BZW4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TM6SF2Q9BZW4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TM6SF2Q9BZW4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TM6SF2Q9BZW4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TM6SF2Q9BZW4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TM6SF2Q9BZW4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TM6SF2Q9BZW4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TM6SF2Q9BZW4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TM6SF2Q9BZW4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TM6SF2Q9BZW4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TM6SF2Q9BZW4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TM6SF2Q9BZW4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TM6SF2Q9BZW4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TM6SF2Q9BZW4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TM6SF2Q9BZW4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TM6SF2Q9BZW4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TM6SF2Q9BZW4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TM6SF2Q9BZW4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TM6SF2Q9BZW4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TM6SF2Q9BZW4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TM6SF2Q9BZW4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TM6SF2Q9BZW4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TM6SF2Q9BZW4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TM6SF2Q9BZW4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TM6SF2Q9BZW4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TM6SF2Q9BZW4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TM6SF2Q9BZW4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TM6SF2Q9BZW4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TM6SF2Q9BZW4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TM6SF2Q9BZW4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TM6SF2Q9BZW4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TM6SF2Q9BZW4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TM6SF2Q9BZW4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TM6SF2Q9BZW4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TM6SF2Q9BZW4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TM6SF2Q9BZW4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TM6SF2Q9BZW4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TM6SF2Q9BZW4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TM6SF2Q9BZW4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TM6SF2Q9BZW4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TM6SF2Q9BZW4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TM6SF2Q9BZW4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TM6SF2Q9BZW4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TM6SF2Q9BZW4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TM6SF2Q9BZW4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TM6SF2Q9BZW4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TM6SF2Q9BZW4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TM6SF2Q9BZW4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TM6SF2Q9BZW4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TM6SF2Q9BZW4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TM6SF2Q9BZW4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TM6SF2Q9BZW4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TM6SF2Q9BZW4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TM6SF2Q9BZW4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TM6SF2Q9BZW4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TM6SF2Q9BZW4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TM6SF2Q9BZW4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TM6SF2Q9BZW4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TM6SF2Q9BZW4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TM6SF2Q9BZW4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TM6SF2Q9BZW4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TM6SF2Q9BZW4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TM6SF2Q9BZW4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TM6SF2Q9BZW4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TM6SF2Q9BZW4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TM6SF2Q9BZW4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TM6SF2Q9BZW4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TM6SF2Q9BZW4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TM6SF2Q9BZW4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TM6SF2Q9BZW4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TM6SF2Q9BZW4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TM6SF2Q9BZW4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TM6SF2Q9BZW4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TM6SF2Q9BZW4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TM6SF2Q9BZW4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TM6SF2Q9BZW4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TM6SF2Q9BZW4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TM6SF2Q9BZW4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TM6SF2Q9BZW4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TM6SF2Q9BZW4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TM6SF2Q9BZW4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TM6SF2Q9BZW4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TM6SF2Q9BZW4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TM6SF2Q9BZW4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TM6SF2Q9BZW4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TM6SF2Q9BZW4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TM6SF2Q9BZW4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TM6SF2Q9BZW4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TM6SF2Q9BZW4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TM6SF2Q9BZW4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms