Protein–RNA interactions for Protein: Q99741

CDC6, Cell division control protein 6 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC6Q99741 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC6Q99741 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC6Q99741 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC6Q99741 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC6Q99741 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC6Q99741 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC6Q99741 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC6Q99741 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDC6Q99741 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDC6Q99741 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDC6Q99741 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDC6Q99741 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDC6Q99741 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDC6Q99741 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDC6Q99741 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDC6Q99741 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDC6Q99741 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDC6Q99741 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDC6Q99741 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDC6Q99741 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDC6Q99741 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CDC6Q99741 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDC6Q99741 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CDC6Q99741 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CDC6Q99741 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDC6Q99741 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC6Q99741 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC6Q99741 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC6Q99741 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC6Q99741 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC6Q99741 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC6Q99741 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC6Q99741 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC6Q99741 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC6Q99741 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC6Q99741 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC6Q99741 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC6Q99741 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC6Q99741 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC6Q99741 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC6Q99741 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC6Q99741 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC6Q99741 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC6Q99741 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC6Q99741 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC6Q99741 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC6Q99741 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC6Q99741 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC6Q99741 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC6Q99741 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC6Q99741 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC6Q99741 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC6Q99741 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC6Q99741 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC6Q99741 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC6Q99741 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC6Q99741 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC6Q99741 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDC6Q99741 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDC6Q99741 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDC6Q99741 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CDC6Q99741 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDC6Q99741 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDC6Q99741 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDC6Q99741 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDC6Q99741 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDC6Q99741 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDC6Q99741 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDC6Q99741 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDC6Q99741 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDC6Q99741 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDC6Q99741 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDC6Q99741 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC6Q99741 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC6Q99741 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC6Q99741 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC6Q99741 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC6Q99741 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDC6Q99741 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CDC6Q99741 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDC6Q99741 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CDC6Q99741 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDC6Q99741 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC6Q99741 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC6Q99741 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC6Q99741 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC6Q99741 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC6Q99741 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC6Q99741 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC6Q99741 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC6Q99741 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC6Q99741 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC6Q99741 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC6Q99741 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC6Q99741 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC6Q99741 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC6Q99741 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC6Q99741 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC6Q99741 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC6Q99741 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.7 ms