Protein–RNA interactions for Protein: Q99638

RAD9A, Cell cycle checkpoint control protein RAD9A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD9AQ99638 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAD9AQ99638 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAD9AQ99638 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAD9AQ99638 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAD9AQ99638 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAD9AQ99638 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RAD9AQ99638 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RAD9AQ99638 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAD9AQ99638 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RAD9AQ99638 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAD9AQ99638 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RAD9AQ99638 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAD9AQ99638 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAD9AQ99638 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAD9AQ99638 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAD9AQ99638 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAD9AQ99638 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAD9AQ99638 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
RAD9AQ99638 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAD9AQ99638 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAD9AQ99638 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAD9AQ99638 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAD9AQ99638 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAD9AQ99638 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAD9AQ99638 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAD9AQ99638 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAD9AQ99638 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAD9AQ99638 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAD9AQ99638 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAD9AQ99638 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAD9AQ99638 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAD9AQ99638 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAD9AQ99638 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RAD9AQ99638 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAD9AQ99638 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAD9AQ99638 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAD9AQ99638 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAD9AQ99638 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAD9AQ99638 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAD9AQ99638 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAD9AQ99638 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RAD9AQ99638 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAD9AQ99638 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAD9AQ99638 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAD9AQ99638 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RAD9AQ99638 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAD9AQ99638 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAD9AQ99638 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAD9AQ99638 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAD9AQ99638 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAD9AQ99638 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RAD9AQ99638 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAD9AQ99638 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAD9AQ99638 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAD9AQ99638 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAD9AQ99638 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAD9AQ99638 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAD9AQ99638 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAD9AQ99638 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RAD9AQ99638 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD9AQ99638 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD9AQ99638 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD9AQ99638 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD9AQ99638 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD9AQ99638 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD9AQ99638 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RAD9AQ99638 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAD9AQ99638 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAD9AQ99638 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAD9AQ99638 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAD9AQ99638 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAD9AQ99638 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RAD9AQ99638 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAD9AQ99638 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAD9AQ99638 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAD9AQ99638 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAD9AQ99638 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAD9AQ99638 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAD9AQ99638 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAD9AQ99638 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAD9AQ99638 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAD9AQ99638 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAD9AQ99638 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAD9AQ99638 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAD9AQ99638 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAD9AQ99638 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAD9AQ99638 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAD9AQ99638 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAD9AQ99638 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAD9AQ99638 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RAD9AQ99638 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAD9AQ99638 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAD9AQ99638 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAD9AQ99638 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAD9AQ99638 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAD9AQ99638 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAD9AQ99638 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAD9AQ99638 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAD9AQ99638 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAD9AQ99638 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms