Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PIK3R4Q99570 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PIK3R4Q99570 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PIK3R4Q99570 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
PIK3R4Q99570 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PIK3R4Q99570 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PIK3R4Q99570 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
PIK3R4Q99570 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PIK3R4Q99570 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PIK3R4Q99570 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PIK3R4Q99570 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PIK3R4Q99570 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PIK3R4Q99570 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PIK3R4Q99570 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PIK3R4Q99570 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PIK3R4Q99570 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PIK3R4Q99570 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
PIK3R4Q99570 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PIK3R4Q99570 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
PIK3R4Q99570 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PIK3R4Q99570 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC33.6■■■□□ 2.97
PIK3R4Q99570 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PIK3R4Q99570 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
PIK3R4Q99570 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC33.6■■■□□ 2.97
PIK3R4Q99570 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
PIK3R4Q99570 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PIK3R4Q99570 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
PIK3R4Q99570 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PIK3R4Q99570 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
PIK3R4Q99570 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PIK3R4Q99570 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PIK3R4Q99570 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
PIK3R4Q99570 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
PIK3R4Q99570 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
PIK3R4Q99570 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
PIK3R4Q99570 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
PIK3R4Q99570 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
PIK3R4Q99570 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
PIK3R4Q99570 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
PIK3R4Q99570 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
PIK3R4Q99570 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
PIK3R4Q99570 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
PIK3R4Q99570 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
PIK3R4Q99570 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
PIK3R4Q99570 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC33.55■■■□□ 2.96
PIK3R4Q99570 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
PIK3R4Q99570 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
PIK3R4Q99570 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
PIK3R4Q99570 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
PIK3R4Q99570 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
PIK3R4Q99570 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
PIK3R4Q99570 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
PIK3R4Q99570 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
PIK3R4Q99570 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
PIK3R4Q99570 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
PIK3R4Q99570 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
PIK3R4Q99570 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PIK3R4Q99570 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
PIK3R4Q99570 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PIK3R4Q99570 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
PIK3R4Q99570 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
PIK3R4Q99570 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
PIK3R4Q99570 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
PIK3R4Q99570 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
PIK3R4Q99570 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
PIK3R4Q99570 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
PIK3R4Q99570 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
PIK3R4Q99570 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC33.51■■■□□ 2.96
PIK3R4Q99570 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
PIK3R4Q99570 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
PIK3R4Q99570 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
PIK3R4Q99570 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
PIK3R4Q99570 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
PIK3R4Q99570 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
PIK3R4Q99570 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
PIK3R4Q99570 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
PIK3R4Q99570 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PIK3R4Q99570 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
PIK3R4Q99570 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PIK3R4Q99570 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PIK3R4Q99570 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PIK3R4Q99570 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
PIK3R4Q99570 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
PIK3R4Q99570 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PIK3R4Q99570 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
PIK3R4Q99570 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
PIK3R4Q99570 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
PIK3R4Q99570 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
PIK3R4Q99570 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
PIK3R4Q99570 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.94
PIK3R4Q99570 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PIK3R4Q99570 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PIK3R4Q99570 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PIK3R4Q99570 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PIK3R4Q99570 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PIK3R4Q99570 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PIK3R4Q99570 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PIK3R4Q99570 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PIK3R4Q99570 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PIK3R4Q99570 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms