Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC38A2Q96QD8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC38A2Q96QD8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC38A2Q96QD8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC38A2Q96QD8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC38A2Q96QD8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC38A2Q96QD8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC38A2Q96QD8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC38A2Q96QD8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC38A2Q96QD8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC38A2Q96QD8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC38A2Q96QD8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC38A2Q96QD8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC38A2Q96QD8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC38A2Q96QD8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC38A2Q96QD8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC38A2Q96QD8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC38A2Q96QD8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC38A2Q96QD8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC38A2Q96QD8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC38A2Q96QD8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC38A2Q96QD8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC38A2Q96QD8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC38A2Q96QD8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC38A2Q96QD8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC38A2Q96QD8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SLC38A2Q96QD8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SLC38A2Q96QD8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SLC38A2Q96QD8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SLC38A2Q96QD8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC38A2Q96QD8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC38A2Q96QD8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC38A2Q96QD8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC38A2Q96QD8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC38A2Q96QD8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC38A2Q96QD8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC38A2Q96QD8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC38A2Q96QD8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC38A2Q96QD8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC38A2Q96QD8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC38A2Q96QD8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC38A2Q96QD8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC38A2Q96QD8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC38A2Q96QD8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC38A2Q96QD8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC38A2Q96QD8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC38A2Q96QD8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC38A2Q96QD8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC38A2Q96QD8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC38A2Q96QD8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC38A2Q96QD8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC38A2Q96QD8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC38A2Q96QD8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC38A2Q96QD8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC38A2Q96QD8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC38A2Q96QD8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC38A2Q96QD8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC38A2Q96QD8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC38A2Q96QD8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC38A2Q96QD8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC38A2Q96QD8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC38A2Q96QD8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC38A2Q96QD8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC38A2Q96QD8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC38A2Q96QD8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC38A2Q96QD8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC38A2Q96QD8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC38A2Q96QD8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC38A2Q96QD8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC38A2Q96QD8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC38A2Q96QD8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC38A2Q96QD8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC38A2Q96QD8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC38A2Q96QD8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC38A2Q96QD8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC38A2Q96QD8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC38A2Q96QD8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC38A2Q96QD8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC38A2Q96QD8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC38A2Q96QD8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC38A2Q96QD8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SLC38A2Q96QD8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SLC38A2Q96QD8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SLC38A2Q96QD8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SLC38A2Q96QD8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC38A2Q96QD8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC38A2Q96QD8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC38A2Q96QD8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC38A2Q96QD8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC38A2Q96QD8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC38A2Q96QD8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC38A2Q96QD8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC38A2Q96QD8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC38A2Q96QD8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC38A2Q96QD8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC38A2Q96QD8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC38A2Q96QD8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC38A2Q96QD8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC38A2Q96QD8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC38A2Q96QD8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms