Protein–RNA interactions for Protein: Q92932

PTPRN2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2Q92932 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRN2Q92932 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRN2Q92932 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRN2Q92932 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRN2Q92932 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRN2Q92932 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRN2Q92932 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRN2Q92932 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRN2Q92932 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRN2Q92932 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRN2Q92932 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPRN2Q92932 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPRN2Q92932 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPRN2Q92932 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPRN2Q92932 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPRN2Q92932 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPRN2Q92932 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPRN2Q92932 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPRN2Q92932 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRN2Q92932 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRN2Q92932 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRN2Q92932 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRN2Q92932 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRN2Q92932 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRN2Q92932 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRN2Q92932 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRN2Q92932 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRN2Q92932 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRN2Q92932 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRN2Q92932 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRN2Q92932 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRN2Q92932 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRN2Q92932 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRN2Q92932 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRN2Q92932 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRN2Q92932 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRN2Q92932 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRN2Q92932 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRN2Q92932 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRN2Q92932 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRN2Q92932 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRN2Q92932 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRN2Q92932 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRN2Q92932 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRN2Q92932 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRN2Q92932 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRN2Q92932 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRN2Q92932 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRN2Q92932 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRN2Q92932 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRN2Q92932 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRN2Q92932 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRN2Q92932 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRN2Q92932 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRN2Q92932 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRN2Q92932 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRN2Q92932 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRN2Q92932 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRN2Q92932 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRN2Q92932 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRN2Q92932 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRN2Q92932 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRN2Q92932 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRN2Q92932 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRN2Q92932 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRN2Q92932 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRN2Q92932 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRN2Q92932 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRN2Q92932 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRN2Q92932 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRN2Q92932 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRN2Q92932 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRN2Q92932 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRN2Q92932 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRN2Q92932 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRN2Q92932 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRN2Q92932 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRN2Q92932 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRN2Q92932 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRN2Q92932 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRN2Q92932 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRN2Q92932 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRN2Q92932 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRN2Q92932 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRN2Q92932 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRN2Q92932 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRN2Q92932 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRN2Q92932 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRN2Q92932 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRN2Q92932 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRN2Q92932 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRN2Q92932 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRN2Q92932 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRN2Q92932 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRN2Q92932 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRN2Q92932 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRN2Q92932 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRN2Q92932 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRN2Q92932 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRN2Q92932 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms