Protein–RNA interactions for Protein: Q92570

NR4A3, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A3Q92570 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NR4A3Q92570 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NR4A3Q92570 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NR4A3Q92570 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NR4A3Q92570 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NR4A3Q92570 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NR4A3Q92570 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NR4A3Q92570 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NR4A3Q92570 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NR4A3Q92570 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NR4A3Q92570 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NR4A3Q92570 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NR4A3Q92570 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NR4A3Q92570 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NR4A3Q92570 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NR4A3Q92570 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NR4A3Q92570 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NR4A3Q92570 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NR4A3Q92570 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NR4A3Q92570 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NR4A3Q92570 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NR4A3Q92570 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NR4A3Q92570 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NR4A3Q92570 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NR4A3Q92570 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NR4A3Q92570 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NR4A3Q92570 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NR4A3Q92570 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NR4A3Q92570 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NR4A3Q92570 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NR4A3Q92570 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NR4A3Q92570 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NR4A3Q92570 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NR4A3Q92570 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NR4A3Q92570 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NR4A3Q92570 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NR4A3Q92570 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NR4A3Q92570 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NR4A3Q92570 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NR4A3Q92570 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NR4A3Q92570 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NR4A3Q92570 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NR4A3Q92570 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NR4A3Q92570 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NR4A3Q92570 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NR4A3Q92570 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NR4A3Q92570 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NR4A3Q92570 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NR4A3Q92570 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NR4A3Q92570 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NR4A3Q92570 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NR4A3Q92570 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NR4A3Q92570 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NR4A3Q92570 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NR4A3Q92570 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NR4A3Q92570 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NR4A3Q92570 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NR4A3Q92570 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NR4A3Q92570 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NR4A3Q92570 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NR4A3Q92570 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NR4A3Q92570 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NR4A3Q92570 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NR4A3Q92570 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NR4A3Q92570 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NR4A3Q92570 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NR4A3Q92570 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NR4A3Q92570 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NR4A3Q92570 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NR4A3Q92570 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NR4A3Q92570 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NR4A3Q92570 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NR4A3Q92570 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NR4A3Q92570 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NR4A3Q92570 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NR4A3Q92570 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NR4A3Q92570 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NR4A3Q92570 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NR4A3Q92570 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NR4A3Q92570 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NR4A3Q92570 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NR4A3Q92570 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NR4A3Q92570 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NR4A3Q92570 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NR4A3Q92570 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NR4A3Q92570 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NR4A3Q92570 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NR4A3Q92570 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NR4A3Q92570 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NR4A3Q92570 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NR4A3Q92570 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NR4A3Q92570 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NR4A3Q92570 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NR4A3Q92570 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NR4A3Q92570 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NR4A3Q92570 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NR4A3Q92570 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NR4A3Q92570 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NR4A3Q92570 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NR4A3Q92570 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms