Protein–RNA interactions for Protein: Q8WU68

U2AF1L4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L4Q8WU68 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
U2AF1L4Q8WU68 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
U2AF1L4Q8WU68 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
U2AF1L4Q8WU68 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
U2AF1L4Q8WU68 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
U2AF1L4Q8WU68 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
U2AF1L4Q8WU68 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
U2AF1L4Q8WU68 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
U2AF1L4Q8WU68 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
U2AF1L4Q8WU68 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
U2AF1L4Q8WU68 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
U2AF1L4Q8WU68 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
U2AF1L4Q8WU68 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
U2AF1L4Q8WU68 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
U2AF1L4Q8WU68 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
U2AF1L4Q8WU68 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
U2AF1L4Q8WU68 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
U2AF1L4Q8WU68 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
U2AF1L4Q8WU68 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
U2AF1L4Q8WU68 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
U2AF1L4Q8WU68 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
U2AF1L4Q8WU68 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
U2AF1L4Q8WU68 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
U2AF1L4Q8WU68 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
U2AF1L4Q8WU68 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
U2AF1L4Q8WU68 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
U2AF1L4Q8WU68 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
U2AF1L4Q8WU68 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
U2AF1L4Q8WU68 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
U2AF1L4Q8WU68 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
U2AF1L4Q8WU68 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
U2AF1L4Q8WU68 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
U2AF1L4Q8WU68 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
U2AF1L4Q8WU68 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
U2AF1L4Q8WU68 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
U2AF1L4Q8WU68 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
U2AF1L4Q8WU68 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
U2AF1L4Q8WU68 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
U2AF1L4Q8WU68 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
U2AF1L4Q8WU68 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
U2AF1L4Q8WU68 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
U2AF1L4Q8WU68 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
U2AF1L4Q8WU68 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
U2AF1L4Q8WU68 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
U2AF1L4Q8WU68 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
U2AF1L4Q8WU68 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
U2AF1L4Q8WU68 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
U2AF1L4Q8WU68 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
U2AF1L4Q8WU68 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
U2AF1L4Q8WU68 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
U2AF1L4Q8WU68 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
U2AF1L4Q8WU68 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
U2AF1L4Q8WU68 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
U2AF1L4Q8WU68 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
U2AF1L4Q8WU68 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
U2AF1L4Q8WU68 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
U2AF1L4Q8WU68 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
U2AF1L4Q8WU68 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
U2AF1L4Q8WU68 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
U2AF1L4Q8WU68 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
U2AF1L4Q8WU68 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
U2AF1L4Q8WU68 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
U2AF1L4Q8WU68 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
U2AF1L4Q8WU68 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
U2AF1L4Q8WU68 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
U2AF1L4Q8WU68 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
U2AF1L4Q8WU68 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
U2AF1L4Q8WU68 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
U2AF1L4Q8WU68 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
U2AF1L4Q8WU68 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
U2AF1L4Q8WU68 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
U2AF1L4Q8WU68 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
U2AF1L4Q8WU68 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
U2AF1L4Q8WU68 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
U2AF1L4Q8WU68 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
U2AF1L4Q8WU68 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
U2AF1L4Q8WU68 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
U2AF1L4Q8WU68 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
U2AF1L4Q8WU68 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
U2AF1L4Q8WU68 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
U2AF1L4Q8WU68 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
U2AF1L4Q8WU68 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
U2AF1L4Q8WU68 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
U2AF1L4Q8WU68 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
U2AF1L4Q8WU68 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
U2AF1L4Q8WU68 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
U2AF1L4Q8WU68 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
U2AF1L4Q8WU68 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
U2AF1L4Q8WU68 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
U2AF1L4Q8WU68 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
U2AF1L4Q8WU68 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
U2AF1L4Q8WU68 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
U2AF1L4Q8WU68 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
U2AF1L4Q8WU68 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
U2AF1L4Q8WU68 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
U2AF1L4Q8WU68 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
U2AF1L4Q8WU68 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
U2AF1L4Q8WU68 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
U2AF1L4Q8WU68 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
U2AF1L4Q8WU68 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms