Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLIP4Q8N3C7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLIP4Q8N3C7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLIP4Q8N3C7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLIP4Q8N3C7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CLIP4Q8N3C7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLIP4Q8N3C7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLIP4Q8N3C7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLIP4Q8N3C7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLIP4Q8N3C7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLIP4Q8N3C7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLIP4Q8N3C7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLIP4Q8N3C7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLIP4Q8N3C7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLIP4Q8N3C7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLIP4Q8N3C7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLIP4Q8N3C7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLIP4Q8N3C7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLIP4Q8N3C7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLIP4Q8N3C7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLIP4Q8N3C7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLIP4Q8N3C7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLIP4Q8N3C7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLIP4Q8N3C7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLIP4Q8N3C7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLIP4Q8N3C7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLIP4Q8N3C7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLIP4Q8N3C7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLIP4Q8N3C7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLIP4Q8N3C7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLIP4Q8N3C7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLIP4Q8N3C7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLIP4Q8N3C7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLIP4Q8N3C7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLIP4Q8N3C7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLIP4Q8N3C7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLIP4Q8N3C7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLIP4Q8N3C7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLIP4Q8N3C7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLIP4Q8N3C7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLIP4Q8N3C7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLIP4Q8N3C7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLIP4Q8N3C7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLIP4Q8N3C7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLIP4Q8N3C7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLIP4Q8N3C7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLIP4Q8N3C7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLIP4Q8N3C7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLIP4Q8N3C7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLIP4Q8N3C7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLIP4Q8N3C7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLIP4Q8N3C7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLIP4Q8N3C7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLIP4Q8N3C7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLIP4Q8N3C7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLIP4Q8N3C7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLIP4Q8N3C7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLIP4Q8N3C7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLIP4Q8N3C7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLIP4Q8N3C7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CLIP4Q8N3C7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLIP4Q8N3C7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CLIP4Q8N3C7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLIP4Q8N3C7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLIP4Q8N3C7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLIP4Q8N3C7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLIP4Q8N3C7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLIP4Q8N3C7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLIP4Q8N3C7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLIP4Q8N3C7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLIP4Q8N3C7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLIP4Q8N3C7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLIP4Q8N3C7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLIP4Q8N3C7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLIP4Q8N3C7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLIP4Q8N3C7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLIP4Q8N3C7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLIP4Q8N3C7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLIP4Q8N3C7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLIP4Q8N3C7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLIP4Q8N3C7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLIP4Q8N3C7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLIP4Q8N3C7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLIP4Q8N3C7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CLIP4Q8N3C7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLIP4Q8N3C7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLIP4Q8N3C7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLIP4Q8N3C7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLIP4Q8N3C7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLIP4Q8N3C7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLIP4Q8N3C7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLIP4Q8N3C7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CLIP4Q8N3C7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLIP4Q8N3C7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLIP4Q8N3C7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLIP4Q8N3C7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLIP4Q8N3C7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLIP4Q8N3C7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLIP4Q8N3C7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLIP4Q8N3C7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
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