Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2K1

UBE2J2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J2Q8N2K1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE2J2Q8N2K1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE2J2Q8N2K1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE2J2Q8N2K1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE2J2Q8N2K1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE2J2Q8N2K1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE2J2Q8N2K1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE2J2Q8N2K1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE2J2Q8N2K1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE2J2Q8N2K1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE2J2Q8N2K1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE2J2Q8N2K1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE2J2Q8N2K1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE2J2Q8N2K1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2J2Q8N2K1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2J2Q8N2K1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2J2Q8N2K1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2J2Q8N2K1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2J2Q8N2K1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2J2Q8N2K1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2J2Q8N2K1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2J2Q8N2K1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2J2Q8N2K1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2J2Q8N2K1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2J2Q8N2K1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2J2Q8N2K1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2J2Q8N2K1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2J2Q8N2K1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2J2Q8N2K1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2J2Q8N2K1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2J2Q8N2K1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2J2Q8N2K1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
UBE2J2Q8N2K1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
UBE2J2Q8N2K1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
UBE2J2Q8N2K1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE2J2Q8N2K1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE2J2Q8N2K1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE2J2Q8N2K1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE2J2Q8N2K1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE2J2Q8N2K1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE2J2Q8N2K1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE2J2Q8N2K1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE2J2Q8N2K1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE2J2Q8N2K1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE2J2Q8N2K1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE2J2Q8N2K1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE2J2Q8N2K1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE2J2Q8N2K1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE2J2Q8N2K1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE2J2Q8N2K1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE2J2Q8N2K1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE2J2Q8N2K1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE2J2Q8N2K1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE2J2Q8N2K1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE2J2Q8N2K1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE2J2Q8N2K1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE2J2Q8N2K1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE2J2Q8N2K1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE2J2Q8N2K1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE2J2Q8N2K1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE2J2Q8N2K1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE2J2Q8N2K1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE2J2Q8N2K1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE2J2Q8N2K1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE2J2Q8N2K1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE2J2Q8N2K1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE2J2Q8N2K1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE2J2Q8N2K1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE2J2Q8N2K1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE2J2Q8N2K1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE2J2Q8N2K1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE2J2Q8N2K1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE2J2Q8N2K1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE2J2Q8N2K1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE2J2Q8N2K1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE2J2Q8N2K1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE2J2Q8N2K1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE2J2Q8N2K1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE2J2Q8N2K1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE2J2Q8N2K1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE2J2Q8N2K1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE2J2Q8N2K1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE2J2Q8N2K1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE2J2Q8N2K1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE2J2Q8N2K1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE2J2Q8N2K1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE2J2Q8N2K1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE2J2Q8N2K1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE2J2Q8N2K1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE2J2Q8N2K1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE2J2Q8N2K1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE2J2Q8N2K1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE2J2Q8N2K1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE2J2Q8N2K1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
UBE2J2Q8N2K1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
UBE2J2Q8N2K1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBE2J2Q8N2K1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UBE2J2Q8N2K1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UBE2J2Q8N2K1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
UBE2J2Q8N2K1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms