Protein–RNA interactions for Protein: Q86VS8

HOOK3, Protein Hook homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOOK3Q86VS8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOOK3Q86VS8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOOK3Q86VS8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOOK3Q86VS8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOOK3Q86VS8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOOK3Q86VS8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOOK3Q86VS8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOOK3Q86VS8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOOK3Q86VS8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOOK3Q86VS8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOOK3Q86VS8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOOK3Q86VS8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOOK3Q86VS8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOOK3Q86VS8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOOK3Q86VS8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOOK3Q86VS8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOOK3Q86VS8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOOK3Q86VS8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOOK3Q86VS8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOOK3Q86VS8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOOK3Q86VS8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOOK3Q86VS8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOOK3Q86VS8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOOK3Q86VS8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOOK3Q86VS8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOOK3Q86VS8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOOK3Q86VS8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOOK3Q86VS8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOOK3Q86VS8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOOK3Q86VS8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOOK3Q86VS8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOOK3Q86VS8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOOK3Q86VS8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOOK3Q86VS8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOOK3Q86VS8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOOK3Q86VS8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOOK3Q86VS8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOOK3Q86VS8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HOOK3Q86VS8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HOOK3Q86VS8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOOK3Q86VS8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOOK3Q86VS8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
HOOK3Q86VS8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOOK3Q86VS8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOOK3Q86VS8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOOK3Q86VS8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOOK3Q86VS8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOOK3Q86VS8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOOK3Q86VS8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOOK3Q86VS8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOOK3Q86VS8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOOK3Q86VS8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOOK3Q86VS8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOOK3Q86VS8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOOK3Q86VS8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOOK3Q86VS8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOOK3Q86VS8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOOK3Q86VS8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOOK3Q86VS8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOOK3Q86VS8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOOK3Q86VS8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOOK3Q86VS8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOOK3Q86VS8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOOK3Q86VS8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOOK3Q86VS8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOOK3Q86VS8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOOK3Q86VS8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOOK3Q86VS8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOOK3Q86VS8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOOK3Q86VS8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOOK3Q86VS8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOOK3Q86VS8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOOK3Q86VS8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOOK3Q86VS8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOOK3Q86VS8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOOK3Q86VS8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HOOK3Q86VS8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOOK3Q86VS8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOOK3Q86VS8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOOK3Q86VS8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOOK3Q86VS8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOOK3Q86VS8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOOK3Q86VS8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOOK3Q86VS8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOOK3Q86VS8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOOK3Q86VS8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOOK3Q86VS8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOOK3Q86VS8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOOK3Q86VS8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOOK3Q86VS8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOOK3Q86VS8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOOK3Q86VS8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOOK3Q86VS8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOOK3Q86VS8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOOK3Q86VS8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOOK3Q86VS8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOOK3Q86VS8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOOK3Q86VS8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOOK3Q86VS8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HOOK3Q86VS8 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms