Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBN2

TRIM61, Putative tripartite motif-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM61Q5EBN2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM61Q5EBN2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM61Q5EBN2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM61Q5EBN2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM61Q5EBN2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM61Q5EBN2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM61Q5EBN2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM61Q5EBN2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM61Q5EBN2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM61Q5EBN2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM61Q5EBN2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM61Q5EBN2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM61Q5EBN2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM61Q5EBN2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM61Q5EBN2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM61Q5EBN2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM61Q5EBN2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM61Q5EBN2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM61Q5EBN2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM61Q5EBN2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM61Q5EBN2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM61Q5EBN2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM61Q5EBN2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM61Q5EBN2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM61Q5EBN2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM61Q5EBN2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM61Q5EBN2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM61Q5EBN2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM61Q5EBN2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM61Q5EBN2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM61Q5EBN2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM61Q5EBN2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM61Q5EBN2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM61Q5EBN2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM61Q5EBN2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM61Q5EBN2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM61Q5EBN2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM61Q5EBN2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM61Q5EBN2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM61Q5EBN2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM61Q5EBN2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM61Q5EBN2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM61Q5EBN2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM61Q5EBN2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM61Q5EBN2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM61Q5EBN2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM61Q5EBN2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM61Q5EBN2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM61Q5EBN2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM61Q5EBN2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM61Q5EBN2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM61Q5EBN2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
TRIM61Q5EBN2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM61Q5EBN2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM61Q5EBN2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM61Q5EBN2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM61Q5EBN2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM61Q5EBN2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM61Q5EBN2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM61Q5EBN2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM61Q5EBN2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM61Q5EBN2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM61Q5EBN2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM61Q5EBN2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM61Q5EBN2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM61Q5EBN2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM61Q5EBN2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM61Q5EBN2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM61Q5EBN2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM61Q5EBN2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM61Q5EBN2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM61Q5EBN2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM61Q5EBN2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM61Q5EBN2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM61Q5EBN2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM61Q5EBN2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM61Q5EBN2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM61Q5EBN2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM61Q5EBN2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM61Q5EBN2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM61Q5EBN2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM61Q5EBN2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM61Q5EBN2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM61Q5EBN2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM61Q5EBN2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM61Q5EBN2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM61Q5EBN2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM61Q5EBN2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM61Q5EBN2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM61Q5EBN2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM61Q5EBN2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM61Q5EBN2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM61Q5EBN2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM61Q5EBN2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM61Q5EBN2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM61Q5EBN2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM61Q5EBN2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM61Q5EBN2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM61Q5EBN2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM61Q5EBN2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms