Protein–RNA interactions for Protein: Q15005

SPCS2, Signal peptidase complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS2Q15005 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPCS2Q15005 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPCS2Q15005 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPCS2Q15005 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPCS2Q15005 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPCS2Q15005 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPCS2Q15005 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPCS2Q15005 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPCS2Q15005 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPCS2Q15005 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPCS2Q15005 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPCS2Q15005 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPCS2Q15005 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPCS2Q15005 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPCS2Q15005 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPCS2Q15005 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPCS2Q15005 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPCS2Q15005 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPCS2Q15005 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPCS2Q15005 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPCS2Q15005 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPCS2Q15005 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPCS2Q15005 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPCS2Q15005 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPCS2Q15005 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPCS2Q15005 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPCS2Q15005 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPCS2Q15005 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPCS2Q15005 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPCS2Q15005 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPCS2Q15005 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPCS2Q15005 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPCS2Q15005 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPCS2Q15005 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPCS2Q15005 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPCS2Q15005 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SPCS2Q15005 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SPCS2Q15005 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SPCS2Q15005 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SPCS2Q15005 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SPCS2Q15005 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPCS2Q15005 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPCS2Q15005 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPCS2Q15005 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPCS2Q15005 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPCS2Q15005 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPCS2Q15005 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPCS2Q15005 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPCS2Q15005 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPCS2Q15005 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPCS2Q15005 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPCS2Q15005 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPCS2Q15005 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPCS2Q15005 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPCS2Q15005 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPCS2Q15005 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPCS2Q15005 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPCS2Q15005 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPCS2Q15005 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPCS2Q15005 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPCS2Q15005 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPCS2Q15005 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPCS2Q15005 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPCS2Q15005 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPCS2Q15005 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPCS2Q15005 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPCS2Q15005 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPCS2Q15005 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPCS2Q15005 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPCS2Q15005 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SPCS2Q15005 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPCS2Q15005 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPCS2Q15005 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPCS2Q15005 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPCS2Q15005 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPCS2Q15005 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPCS2Q15005 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SPCS2Q15005 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPCS2Q15005 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPCS2Q15005 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPCS2Q15005 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SPCS2Q15005 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SPCS2Q15005 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPCS2Q15005 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPCS2Q15005 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPCS2Q15005 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPCS2Q15005 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPCS2Q15005 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPCS2Q15005 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPCS2Q15005 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPCS2Q15005 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SPCS2Q15005 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SPCS2Q15005 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SPCS2Q15005 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SPCS2Q15005 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SPCS2Q15005 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SPCS2Q15005 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SPCS2Q15005 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPCS2Q15005 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPCS2Q15005 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms