Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GPM6BQ13491 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPM6BQ13491 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPM6BQ13491 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPM6BQ13491 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPM6BQ13491 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPM6BQ13491 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GPM6BQ13491 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GPM6BQ13491 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPM6BQ13491 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPM6BQ13491 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GPM6BQ13491 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GPM6BQ13491 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPM6BQ13491 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPM6BQ13491 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPM6BQ13491 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPM6BQ13491 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GPM6BQ13491 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPM6BQ13491 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPM6BQ13491 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPM6BQ13491 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GPM6BQ13491 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPM6BQ13491 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPM6BQ13491 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPM6BQ13491 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPM6BQ13491 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPM6BQ13491 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPM6BQ13491 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPM6BQ13491 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPM6BQ13491 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPM6BQ13491 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GPM6BQ13491 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPM6BQ13491 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPM6BQ13491 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPM6BQ13491 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPM6BQ13491 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GPM6BQ13491 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPM6BQ13491 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GPM6BQ13491 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPM6BQ13491 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPM6BQ13491 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPM6BQ13491 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPM6BQ13491 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPM6BQ13491 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPM6BQ13491 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPM6BQ13491 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPM6BQ13491 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPM6BQ13491 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GPM6BQ13491 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPM6BQ13491 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPM6BQ13491 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPM6BQ13491 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPM6BQ13491 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPM6BQ13491 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GPM6BQ13491 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPM6BQ13491 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPM6BQ13491 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPM6BQ13491 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPM6BQ13491 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPM6BQ13491 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPM6BQ13491 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPM6BQ13491 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPM6BQ13491 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GPM6BQ13491 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPM6BQ13491 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPM6BQ13491 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPM6BQ13491 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPM6BQ13491 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPM6BQ13491 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GPM6BQ13491 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPM6BQ13491 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPM6BQ13491 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPM6BQ13491 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
GPM6BQ13491 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
GPM6BQ13491 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPM6BQ13491 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPM6BQ13491 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPM6BQ13491 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPM6BQ13491 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPM6BQ13491 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPM6BQ13491 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPM6BQ13491 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPM6BQ13491 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPM6BQ13491 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPM6BQ13491 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPM6BQ13491 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPM6BQ13491 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPM6BQ13491 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPM6BQ13491 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPM6BQ13491 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GPM6BQ13491 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GPM6BQ13491 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GPM6BQ13491 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPM6BQ13491 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPM6BQ13491 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPM6BQ13491 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GPM6BQ13491 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPM6BQ13491 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPM6BQ13491 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GPM6BQ13491 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
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