Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
DDR1Q08345 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
DDR1Q08345 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
DDR1Q08345 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
DDR1Q08345 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
DDR1Q08345 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
DDR1Q08345 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
DDR1Q08345 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
DDR1Q08345 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
DDR1Q08345 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
DDR1Q08345 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
DDR1Q08345 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
DDR1Q08345 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
DDR1Q08345 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
DDR1Q08345 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
DDR1Q08345 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
DDR1Q08345 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
DDR1Q08345 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
DDR1Q08345 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
DDR1Q08345 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
DDR1Q08345 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
DDR1Q08345 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
DDR1Q08345 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
DDR1Q08345 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
DDR1Q08345 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC29.85■■■□□ 2.37
DDR1Q08345 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
DDR1Q08345 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
DDR1Q08345 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
DDR1Q08345 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
DDR1Q08345 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
DDR1Q08345 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
DDR1Q08345 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
DDR1Q08345 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
DDR1Q08345 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
DDR1Q08345 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
DDR1Q08345 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
DDR1Q08345 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
DDR1Q08345 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
DDR1Q08345 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
DDR1Q08345 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
DDR1Q08345 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
DDR1Q08345 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
DDR1Q08345 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
DDR1Q08345 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
DDR1Q08345 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
DDR1Q08345 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
DDR1Q08345 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
DDR1Q08345 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
DDR1Q08345 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
DDR1Q08345 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
DDR1Q08345 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
DDR1Q08345 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
DDR1Q08345 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
DDR1Q08345 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
DDR1Q08345 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
DDR1Q08345 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
DDR1Q08345 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
DDR1Q08345 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
DDR1Q08345 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
DDR1Q08345 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
DDR1Q08345 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
DDR1Q08345 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
DDR1Q08345 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
DDR1Q08345 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
DDR1Q08345 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
DDR1Q08345 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
DDR1Q08345 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
DDR1Q08345 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
DDR1Q08345 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
DDR1Q08345 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
DDR1Q08345 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
DDR1Q08345 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
DDR1Q08345 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
DDR1Q08345 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
DDR1Q08345 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
DDR1Q08345 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
DDR1Q08345 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
DDR1Q08345 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
DDR1Q08345 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
DDR1Q08345 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC29.74■■■□□ 2.35
DDR1Q08345 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
DDR1Q08345 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
DDR1Q08345 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
DDR1Q08345 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
DDR1Q08345 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
DDR1Q08345 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
DDR1Q08345 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
DDR1Q08345 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
DDR1Q08345 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
DDR1Q08345 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
DDR1Q08345 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
DDR1Q08345 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
DDR1Q08345 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
DDR1Q08345 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
DDR1Q08345 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
DDR1Q08345 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
DDR1Q08345 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
DDR1Q08345 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
DDR1Q08345 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
DDR1Q08345 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms