Protein–RNA interactions for Protein: P80723

BASP1, Brain acid soluble protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BASP1P80723 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BASP1P80723 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BASP1P80723 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BASP1P80723 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BASP1P80723 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BASP1P80723 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BASP1P80723 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BASP1P80723 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BASP1P80723 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BASP1P80723 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BASP1P80723 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BASP1P80723 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BASP1P80723 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BASP1P80723 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BASP1P80723 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BASP1P80723 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
BASP1P80723 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BASP1P80723 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BASP1P80723 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BASP1P80723 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BASP1P80723 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
BASP1P80723 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
BASP1P80723 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BASP1P80723 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
BASP1P80723 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BASP1P80723 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
BASP1P80723 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BASP1P80723 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BASP1P80723 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BASP1P80723 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BASP1P80723 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BASP1P80723 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BASP1P80723 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BASP1P80723 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BASP1P80723 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BASP1P80723 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BASP1P80723 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BASP1P80723 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BASP1P80723 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BASP1P80723 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BASP1P80723 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BASP1P80723 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BASP1P80723 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BASP1P80723 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BASP1P80723 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BASP1P80723 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BASP1P80723 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BASP1P80723 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BASP1P80723 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BASP1P80723 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BASP1P80723 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BASP1P80723 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BASP1P80723 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BASP1P80723 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BASP1P80723 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BASP1P80723 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BASP1P80723 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BASP1P80723 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BASP1P80723 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BASP1P80723 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BASP1P80723 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BASP1P80723 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BASP1P80723 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BASP1P80723 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BASP1P80723 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BASP1P80723 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BASP1P80723 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BASP1P80723 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BASP1P80723 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BASP1P80723 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BASP1P80723 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
BASP1P80723 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BASP1P80723 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BASP1P80723 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BASP1P80723 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BASP1P80723 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BASP1P80723 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BASP1P80723 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BASP1P80723 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BASP1P80723 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
BASP1P80723 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BASP1P80723 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BASP1P80723 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
BASP1P80723 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BASP1P80723 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BASP1P80723 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BASP1P80723 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BASP1P80723 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BASP1P80723 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BASP1P80723 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BASP1P80723 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BASP1P80723 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BASP1P80723 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BASP1P80723 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BASP1P80723 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
BASP1P80723 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BASP1P80723 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BASP1P80723 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BASP1P80723 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BASP1P80723 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms