Protein–RNA interactions for Protein: P55209

NAP1L1, Nucleosome assembly protein 1-like 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L1P55209 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NAP1L1P55209 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NAP1L1P55209 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NAP1L1P55209 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NAP1L1P55209 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NAP1L1P55209 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NAP1L1P55209 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NAP1L1P55209 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NAP1L1P55209 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NAP1L1P55209 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NAP1L1P55209 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NAP1L1P55209 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NAP1L1P55209 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NAP1L1P55209 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NAP1L1P55209 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NAP1L1P55209 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NAP1L1P55209 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NAP1L1P55209 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NAP1L1P55209 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NAP1L1P55209 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NAP1L1P55209 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NAP1L1P55209 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NAP1L1P55209 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NAP1L1P55209 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NAP1L1P55209 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NAP1L1P55209 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NAP1L1P55209 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NAP1L1P55209 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NAP1L1P55209 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NAP1L1P55209 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NAP1L1P55209 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NAP1L1P55209 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NAP1L1P55209 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NAP1L1P55209 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NAP1L1P55209 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NAP1L1P55209 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NAP1L1P55209 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NAP1L1P55209 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NAP1L1P55209 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NAP1L1P55209 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NAP1L1P55209 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NAP1L1P55209 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NAP1L1P55209 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NAP1L1P55209 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NAP1L1P55209 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NAP1L1P55209 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NAP1L1P55209 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NAP1L1P55209 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NAP1L1P55209 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NAP1L1P55209 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NAP1L1P55209 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NAP1L1P55209 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NAP1L1P55209 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NAP1L1P55209 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NAP1L1P55209 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NAP1L1P55209 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NAP1L1P55209 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NAP1L1P55209 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NAP1L1P55209 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NAP1L1P55209 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NAP1L1P55209 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NAP1L1P55209 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NAP1L1P55209 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NAP1L1P55209 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NAP1L1P55209 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NAP1L1P55209 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NAP1L1P55209 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NAP1L1P55209 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NAP1L1P55209 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NAP1L1P55209 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
NAP1L1P55209 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NAP1L1P55209 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NAP1L1P55209 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NAP1L1P55209 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NAP1L1P55209 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NAP1L1P55209 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NAP1L1P55209 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NAP1L1P55209 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NAP1L1P55209 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NAP1L1P55209 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NAP1L1P55209 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NAP1L1P55209 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NAP1L1P55209 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NAP1L1P55209 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NAP1L1P55209 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NAP1L1P55209 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NAP1L1P55209 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NAP1L1P55209 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NAP1L1P55209 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NAP1L1P55209 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NAP1L1P55209 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NAP1L1P55209 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NAP1L1P55209 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NAP1L1P55209 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NAP1L1P55209 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NAP1L1P55209 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NAP1L1P55209 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NAP1L1P55209 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NAP1L1P55209 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NAP1L1P55209 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms