Protein–RNA interactions for Protein: P51861

CDR1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR1P51861 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDR1P51861 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDR1P51861 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDR1P51861 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDR1P51861 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CDR1P51861 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDR1P51861 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDR1P51861 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDR1P51861 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDR1P51861 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDR1P51861 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDR1P51861 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDR1P51861 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
CDR1P51861 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
CDR1P51861 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDR1P51861 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDR1P51861 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDR1P51861 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDR1P51861 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDR1P51861 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDR1P51861 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDR1P51861 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDR1P51861 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CDR1P51861 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDR1P51861 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDR1P51861 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDR1P51861 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDR1P51861 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDR1P51861 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDR1P51861 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDR1P51861 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDR1P51861 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDR1P51861 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDR1P51861 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDR1P51861 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDR1P51861 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDR1P51861 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDR1P51861 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDR1P51861 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDR1P51861 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDR1P51861 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDR1P51861 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDR1P51861 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDR1P51861 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDR1P51861 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDR1P51861 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDR1P51861 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDR1P51861 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDR1P51861 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDR1P51861 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CDR1P51861 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDR1P51861 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDR1P51861 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDR1P51861 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDR1P51861 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDR1P51861 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDR1P51861 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDR1P51861 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDR1P51861 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDR1P51861 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDR1P51861 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDR1P51861 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDR1P51861 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDR1P51861 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDR1P51861 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDR1P51861 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDR1P51861 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDR1P51861 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDR1P51861 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CDR1P51861 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CDR1P51861 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDR1P51861 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDR1P51861 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDR1P51861 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDR1P51861 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDR1P51861 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDR1P51861 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CDR1P51861 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDR1P51861 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CDR1P51861 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDR1P51861 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDR1P51861 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDR1P51861 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDR1P51861 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDR1P51861 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDR1P51861 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDR1P51861 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDR1P51861 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDR1P51861 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDR1P51861 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDR1P51861 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDR1P51861 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDR1P51861 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDR1P51861 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDR1P51861 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDR1P51861 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDR1P51861 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDR1P51861 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDR1P51861 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDR1P51861 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms