Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GJA8P48165 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GJA8P48165 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GJA8P48165 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GJA8P48165 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GJA8P48165 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
GJA8P48165 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GJA8P48165 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
GJA8P48165 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GJA8P48165 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GJA8P48165 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
GJA8P48165 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GJA8P48165 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GJA8P48165 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GJA8P48165 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GJA8P48165 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GJA8P48165 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
GJA8P48165 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GJA8P48165 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GJA8P48165 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GJA8P48165 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GJA8P48165 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GJA8P48165 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GJA8P48165 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GJA8P48165 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
GJA8P48165 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GJA8P48165 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GJA8P48165 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GJA8P48165 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GJA8P48165 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GJA8P48165 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GJA8P48165 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GJA8P48165 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GJA8P48165 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GJA8P48165 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
GJA8P48165 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GJA8P48165 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GJA8P48165 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
GJA8P48165 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GJA8P48165 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GJA8P48165 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GJA8P48165 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GJA8P48165 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GJA8P48165 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GJA8P48165 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
GJA8P48165 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GJA8P48165 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GJA8P48165 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GJA8P48165 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GJA8P48165 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GJA8P48165 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GJA8P48165 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GJA8P48165 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
GJA8P48165 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
GJA8P48165 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GJA8P48165 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
GJA8P48165 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
GJA8P48165 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GJA8P48165 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GJA8P48165 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GJA8P48165 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
GJA8P48165 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GJA8P48165 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GJA8P48165 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GJA8P48165 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GJA8P48165 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GJA8P48165 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GJA8P48165 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GJA8P48165 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GJA8P48165 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GJA8P48165 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
GJA8P48165 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GJA8P48165 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GJA8P48165 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GJA8P48165 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GJA8P48165 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GJA8P48165 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GJA8P48165 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
GJA8P48165 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GJA8P48165 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GJA8P48165 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
GJA8P48165 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GJA8P48165 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GJA8P48165 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GJA8P48165 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GJA8P48165 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GJA8P48165 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GJA8P48165 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GJA8P48165 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GJA8P48165 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GJA8P48165 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GJA8P48165 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GJA8P48165 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GJA8P48165 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GJA8P48165 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GJA8P48165 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GJA8P48165 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GJA8P48165 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GJA8P48165 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GJA8P48165 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms