Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRATP43155 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRATP43155 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CRATP43155 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRATP43155 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRATP43155 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRATP43155 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRATP43155 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRATP43155 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRATP43155 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRATP43155 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRATP43155 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRATP43155 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRATP43155 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRATP43155 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRATP43155 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRATP43155 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRATP43155 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRATP43155 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRATP43155 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRATP43155 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRATP43155 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRATP43155 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRATP43155 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRATP43155 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRATP43155 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRATP43155 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRATP43155 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRATP43155 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRATP43155 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRATP43155 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRATP43155 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRATP43155 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRATP43155 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRATP43155 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRATP43155 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRATP43155 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRATP43155 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CRATP43155 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CRATP43155 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CRATP43155 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRATP43155 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRATP43155 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRATP43155 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRATP43155 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRATP43155 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRATP43155 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CRATP43155 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRATP43155 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRATP43155 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRATP43155 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRATP43155 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRATP43155 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRATP43155 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRATP43155 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRATP43155 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRATP43155 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRATP43155 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRATP43155 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRATP43155 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRATP43155 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRATP43155 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRATP43155 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRATP43155 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRATP43155 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRATP43155 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRATP43155 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRATP43155 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRATP43155 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRATP43155 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRATP43155 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRATP43155 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRATP43155 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRATP43155 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRATP43155 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRATP43155 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CRATP43155 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRATP43155 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRATP43155 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRATP43155 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRATP43155 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRATP43155 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRATP43155 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRATP43155 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRATP43155 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRATP43155 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRATP43155 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRATP43155 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRATP43155 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRATP43155 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRATP43155 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRATP43155 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CRATP43155 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRATP43155 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRATP43155 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRATP43155 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRATP43155 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CRATP43155 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRATP43155 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRATP43155 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.9 ms