Protein–RNA interactions for Protein: P40855

PEX19, Peroxisomal biogenesis factor 19, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX19P40855 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PEX19P40855 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PEX19P40855 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PEX19P40855 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PEX19P40855 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PEX19P40855 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PEX19P40855 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PEX19P40855 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PEX19P40855 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PEX19P40855 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PEX19P40855 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PEX19P40855 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PEX19P40855 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PEX19P40855 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PEX19P40855 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PEX19P40855 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PEX19P40855 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PEX19P40855 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PEX19P40855 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PEX19P40855 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PEX19P40855 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PEX19P40855 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PEX19P40855 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PEX19P40855 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PEX19P40855 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PEX19P40855 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PEX19P40855 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PEX19P40855 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PEX19P40855 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PEX19P40855 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PEX19P40855 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PEX19P40855 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PEX19P40855 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PEX19P40855 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PEX19P40855 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PEX19P40855 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PEX19P40855 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PEX19P40855 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PEX19P40855 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PEX19P40855 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PEX19P40855 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PEX19P40855 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PEX19P40855 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PEX19P40855 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PEX19P40855 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PEX19P40855 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PEX19P40855 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PEX19P40855 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PEX19P40855 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PEX19P40855 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PEX19P40855 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PEX19P40855 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PEX19P40855 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PEX19P40855 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PEX19P40855 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PEX19P40855 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PEX19P40855 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PEX19P40855 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PEX19P40855 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PEX19P40855 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PEX19P40855 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PEX19P40855 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PEX19P40855 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PEX19P40855 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PEX19P40855 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PEX19P40855 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PEX19P40855 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PEX19P40855 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PEX19P40855 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PEX19P40855 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PEX19P40855 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PEX19P40855 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PEX19P40855 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PEX19P40855 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PEX19P40855 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PEX19P40855 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PEX19P40855 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PEX19P40855 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PEX19P40855 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PEX19P40855 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PEX19P40855 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PEX19P40855 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PEX19P40855 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PEX19P40855 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PEX19P40855 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PEX19P40855 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PEX19P40855 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PEX19P40855 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PEX19P40855 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PEX19P40855 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PEX19P40855 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PEX19P40855 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PEX19P40855 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PEX19P40855 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PEX19P40855 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PEX19P40855 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PEX19P40855 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PEX19P40855 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PEX19P40855 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PEX19P40855 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms