Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSPOP30536 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSPOP30536 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSPOP30536 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSPOP30536 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSPOP30536 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSPOP30536 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSPOP30536 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSPOP30536 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSPOP30536 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSPOP30536 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSPOP30536 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSPOP30536 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSPOP30536 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSPOP30536 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSPOP30536 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSPOP30536 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSPOP30536 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSPOP30536 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSPOP30536 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSPOP30536 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSPOP30536 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSPOP30536 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSPOP30536 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSPOP30536 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSPOP30536 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSPOP30536 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSPOP30536 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSPOP30536 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSPOP30536 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSPOP30536 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSPOP30536 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSPOP30536 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSPOP30536 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSPOP30536 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSPOP30536 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSPOP30536 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSPOP30536 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSPOP30536 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSPOP30536 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSPOP30536 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TSPOP30536 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TSPOP30536 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TSPOP30536 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSPOP30536 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSPOP30536 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSPOP30536 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSPOP30536 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSPOP30536 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSPOP30536 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSPOP30536 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSPOP30536 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSPOP30536 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSPOP30536 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSPOP30536 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSPOP30536 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSPOP30536 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSPOP30536 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSPOP30536 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSPOP30536 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TSPOP30536 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TSPOP30536 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TSPOP30536 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TSPOP30536 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TSPOP30536 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TSPOP30536 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TSPOP30536 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TSPOP30536 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TSPOP30536 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TSPOP30536 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TSPOP30536 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSPOP30536 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSPOP30536 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSPOP30536 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSPOP30536 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSPOP30536 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSPOP30536 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSPOP30536 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSPOP30536 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSPOP30536 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSPOP30536 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSPOP30536 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSPOP30536 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSPOP30536 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSPOP30536 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSPOP30536 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSPOP30536 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSPOP30536 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSPOP30536 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSPOP30536 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSPOP30536 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSPOP30536 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TSPOP30536 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSPOP30536 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSPOP30536 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSPOP30536 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSPOP30536 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TSPOP30536 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSPOP30536 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSPOP30536 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms